בדיונים שקדמו לתקיפה הדרמטית בקטאר, התגלעה מחלוקת בצמרת הביטחונית והמדינית. הרמטכ"ל, ראש המוסד וראש המל"ל הביעו התנגדות לעיתוי שבו בוצעה הפעולה. לטענתם, היה עדיף להמתין לסיטואציה מבצעית טובה יותר בימים הקרובים ורק אז להוציא את התקיפה לפועל.

עם זאת, ראש הממשלה ושר הביטחון חשבו אחרת, והנחו את המערכת לפעול באופן מיידי. ואכן, התקיפה יצאה לפועל על פי החלטתם.
כעת, במערכת הביטחון מודים כי התוצאה שהושגה הייתה יכולה להיות חד משמעית יותר. גורם ביטחוני טוען כי "במידה שהיו מוטלים חימושים כבדים יותר, לא היה ספק באשר לתוצאות התקיפה". לדבריו, העובדה שהפגיעה הייתה ממוקדת מאוד ופגעה בקומה אחת בלבד, היא כנראה זו שהובילה לתוצאה חלקית".

למרות חילוקי הדעות והתוצאה שאינה ודאית, גורם בכיר במערכת הביטחון אמר חדשות 14 כי המסר האסטרטגי הועבר: "אין מדינות וערי מקלט למחבלים באשר הם, באף מדינה בעולם. נרדוף אותם עד שיחוסלו".
