מאחורי הקלעים של התקיפה הדרמטית באיראן עמדו לא רק מטוסי חיל האוויר – אלא גם ידו הארוכה והמדויקת של המוסד. באמצעות מבצע חשאי מורכב, הצליחו סוכני הארגון להחדיר עמוק לתוך איראן מערכות תקיפה מוסוות, יחידות קומנדו מתקדמות ובסיסי שיגור למל"טים נפיצים – שהופעלו בדיוק מתוזמן עם תחילת המתקפה, והשמידו את מערכי ההגנה הקריטיים של המשטר.
במרכז איראן, יחידות קומנדו של המוסד פרסו מערכות נשק מונחות מדויק בשטחים פתוחים בקרבת אתרים של מערכות טילי קרקע-אוויר איראניות. עם תחילת התקיפה הישראלית, המערכות הופעלו מרחוק, ושיגרו טילים מדויקים שפגעו במטרות בו-זמנית.
בפעולות חשאיות, המוסד החדיר מערכות תקיפה מתקדמות וטכנולוגיות מתוחכמות שהוסתרו בתוך כלי רכב אזרחיים. עם תחילת המתקפה, הופעלו המערכות המוסוות והשמידו לחלוטין את מערכי ההגנה האווירית של איראן.
המוסד הקים גם בסיסי שיגור קדמיים למל”טים נפיצים, שהוברחו לעומק שטח איראן זמן רב לפני המבצע. במהלך התקיפה, המל”טים הופעלו ושוגרו לעבר משגרים של טילים קרקע-קרקע בבסיס אספאג’אבאד סמוך לטהראן – מתקן שמוגדר כאיום על נכסים אסטרטגיים ואזרחים ישראלים
