יממה לאחר פטירתו של ראש המוסד לשעבר שבתי שביט ז"ל, רה"מ בנימין נתניהו שלח תנחומים לבני משפחתו – וספד לו. "אני שולח תנחומים למשפחתו של שבתאי שביט ז״ל. למרות חילוקי הדעות העמוקים בינינו, תמיד הערכתי את שירותו החשוב ואת תרומתו למען ביטחון ישראל. יהי זכרו ברוך".
האיחור המשמעותי בהודעת ההספד של רה"מ לראש המוסד לשעבר אינה מקרית כלל. שביט נהג לבקר בחריפות את נתניהו לאורך השנים. בעבר התבטא שביט בגסות כלפי בוחריו של נתניהו – וטען כי הם "חסרי דעת וחסרי הבנה". בריאיון לעיתון מעריב אמר: "הבייס הפוליטי שלו זה אנשים שהסף הנורמטיבי שלהם הוא בגובה הדשא".
שבתי שביט היה ראש המוסד השביעי. הוא הלך לעולמו אתמול (שלישי) במהלך חופשה פרטית באיטליה. עם היוודע דבר פטירתו הוציא ראש המוסד, דוד ברנע, הודעת השתתפות בצער המשפחה ומשרתי המוסד: "שבתי שביט, ראש המוסד השביעי היה מעמוד התווך של עולם המבצעים, המודיעין, והביטחון האסטרטגי של מדינת ישראל".
שביט הצטרף למוסד ב-1964, והחל את דרכו בארגון כקצין איסוף של ה'צומת' באיראן, כיהן בתפקידים מבצעיים ופיקודיים בארץ ובחו״ל ובראשם ראש אגף קיסריה, ומשנה לראש המוסד.
בתקופת כהונתו כראש המוסד, פעל שביט להרחבה וחיזוק של היחסים החשאיים בין המוסד לארגונים ומדינות במרחב האזורי והגלובלי, ובראשם תרומתו לכינון הסכם השלום שנחתם בין ישראל לירדן.
לאחר פרישתו המשיך שביט לתרום רבות לשימור המורשת והידע הארגוני, וחנך דורות של ראשי מוסד ומפקדים בארגון. שביט כיהן כנשיא אגודת הגמלאים של המוסד במשך שנים ארוכות וראה בכך שליחות חשובה.
