בית המשפט העליון קבע היום (ב') כי הממשלה אינה יכולה להמשיך להסמיך את השב"כ באופן גורף לסייע בביצוע חקירות אפידמיולוגיות ועליה להגביל את ההסתייעות בשב"כ רק לחולים שאינם משתפים פעולה בחקירה אפידמיולוגית אנושית או שלא דיווחו כלל על מגעים.

בפסק הדין נכתב כי "יופסק השימוש הגורף בשב"כ וכי על הממשלה לגבש קריטריונים מדידים שיקבעו את היקף ההסתייעות בשב"כ ויבטיחו כי הסתייעות זו תהווה כלי משלים בלבד". עוד קבע בית המשפט כי לשם גיבוש המדיניות החדשה תיקבע תקופת התארגנות כך שהמועד האחרון לגיבושן יהא יום 14.3.2021, כלומר בעוד שבועיים.
ממועד זה ואילך, תוגבל הסמכת השב"כ רק לאותם מקרים שבהם החולה המאומת אינו משתף פעולה בחקירה האפידמיולוגית "בין בכוונת מכוון ובין בשל מגבלות זיכרון או שלא מסר כלל דיווח על מגעים" כך לפי פסק הדין. עוד ציינו השופטים כי מדובר ב"פגיעה דרקונית בזכות לפרטיות ובדמוקרטיה".

על רקע ההכרעה תוקף סגן שר הבריאות, ח"כ יואב קיש, את בית המשפט העליון. סגן השר קיש אמר ההכקעה מהווה "התערבות בוטה של בג"ץ במלחמה בנגיף". עוד הוסיף קיש כי: "עד היום הצלנו יותר מ-500 מאות חיים של ישראלים בזכות היכולת של השב"כ". על פסיקת העליון אמר: "לדעתי זהו פשע נגד בריאות אזרחי ישראל. נשאר רק לברך על הישג החיסונים האדיר שאולי ייתר את הצורך".
