סימני השאלה סביב מותו של נבלני: מרגלי הקרמלין ביקרו בכלא של אלכסיי נבלני ימים ספורים לפני מותו, כך טען מקור לטיימס, רוסיה הודיעה על מותו של האויב מספר אחת של פוטין ביום שישי, כשמבקרים ברחבי העולם קראו לכך "רצח". דוברו של נבלני מסר כי הם דורשים את גופתו ולא מקבלים תשובות.
עם זאת, פרטים נוספים שהובילו למותו נחשפו בציר זמן על ידי ארגון זכויות אדם. הארגון טען שכמה מרגלים רוסים משירות הכליאה הפדרלי (FSIN) ביקרו ביום רביעי בכלא 'זאב הקוטב' – שבו הוחזק נבלני. הם טענו שבעודם שם המרגלים ניתקו ופירקו חלק ממצלמות האבטחה ומכשירי ההאזנה בתוך תא הכלא של נבלני.
אולם, אין זה היה לפי סוכנויות הידיעות אין זה היה האירוע המוזר היחיד סביב מותו של מנהיג האופוזיציה ביום שישי ויש שטוענים שהמהירות שבה הגיבו השלטונות על הטרגדיה מעלה תמיהה סביב הנושא. שלטונות הקרמלין אמרו בתחילה שנבלני "התמוטט ומת" והסיבה לטענתם היא קריש דם לכאורה, אך אתמול טענו כי הוא מת מ"תסמונת המוות הפתאומי".
1+בהודעה מטעם שירות הכליאה הפדרלי במחוז האוטונומי ימאלו-ננץ, שם נבלני הוחזק במושבת העונשין מספר 3 כחלק מעונש של 30 שנות מאסר, נכתב כי הוא "חש לא טוב אחרי הליכה וכמעט מיד איבד את ההכרה". "צוותים רפואיים הגיעו מיד וצוות חירום רפואי נקרא למקום", ציינה ההודעה שהוסיפה כי למרות מאמצי ההחייאה, נקבע מותו של נבלני.
