בהמשך לפרסום הראשון של ראש דסק התחקירים בחדשות 14 עקיבא ביגמן על כך שהאמריקנים עשויים לפתוח בחקירה נגד לוחמי צה"ל, שר הביטחון בני גנץ הגיב הערב: "ההחלטה של משרד המשפטים האמריקאי לחקור את מותה המצער של שירין אבו עאקלה היא טעות קשה. צה"ל ביצע חקירה עצמאית ומקצועית, שהוצגה לאמריקאים ששותפו בפרטים".
גנץ הוסיף, "הבהרתי לנציגי האמריקאים שאנו עומדים מאחורי חיילי צה"ל, שלא נשתף פעולה עם אף חקירה חיצונית, ולא נאפשר התערבות בענייניה הפנימיים של ישראל".
2+מיש דין נמסר בתגובה להחלטת ה-FBI לפתוח בחקירה בנושא הרג העיתונאית שירין אבו עאקלה: "אנחנו מברכים על פתיחת החקירה, כפי שאמרנו מיום האירוע, רק חקירה בינלאומית בלתי תלויה יכולה להביא לחקר האמת. חשוב להדגיש שמדובר באירוע יוצא דופן שכן מדובר באזרחית אמריקאית ועיתונאית מפורסמת. ברוב המקרים (72% מהתלונות שמגישים פלסטינים) הצבא אינו מבצע חקירה פלילית. חקירה יסודית ורצינית נדרשת לא רק כשמדובר באזרחית אמריקאית".
צחי הנגבי הגיב באולפן 'עכשיו 14': "למזלי חלק מהמורשת שספגתי היא לגדול לצידו של יצחק שמיר. ראיתי מנהיג שיודע שחובה לעבוד עם ארה"ב וכשיש סוגיות שאנחנו צריכים לדאוג לגורלנו אנחנו יודעים להגיד רבותיי זה לא עניין שלכם".
2+כאמור, משמעות החקירה הפלילית שתתנהל על ידי ה-FBI לגבי פעילות של צה"ל ביהודה ושומרון הינו דבר חריג ביותר ואולי אף חסר תקדים. החקירה עשויה להוביל לבקשה אמריקנית לחקור את הלוחמים שהיו מעורבים בתקרית המוות של אבו עאקלה, דבר שישראל לא תוכל להסכים לו.
