לאחר שבג"ץ אישר את מינויו של האלוף רומן גופמן לראש המוסד, פרסם ראש המוסד היוצא דוד ברנע מסר פומבי לעובדי הארגון – ובו קרא להתייצב מאחורי מחליפו, למרות המתקפה החריגה והפומבית של ברנע סביב המינוי.

בהודעה שנשלחה לעובדי המוסד ולמפקדיו כתב ברנע: "אני מצפה מכולכם לעמוד לימינו של האלוף גופמן, ולהמשיך לסייע לו בכניסתו לתפקיד באופן הטוב ביותר". עוד הוסיף כי "לפנינו אתגרים מורכבים העומדים בליבת ביטחון מדינת ישראל ובהם למוסד תפקיד מרכזי ומשפיע. הצלחתו של האלוף גופמן היא הצלחת המוסד והצלחת מדינת ישראל כולה".
כאמור, המסר של ברנע נחשב דרמטי במיוחד על רקע ההתנגדות החריפה שהביע בעבר למינויו של גופמן. במסגרת ההליך שהתנהל בפני ועדת גרוניס ובבג"ץ, העביר ברנע מכתב חסוי ובו טענות קשות נגד גופמן, שלפיהן אינו עומד בסטנדרט טוהר המידות הנדרש לתפקיד ראש המוסד. בין היתר טען כי קיימת אצל גופמן "בעיה בהצבת גבולות עצמיים" וכי הוא עלול "לעשות דין לעצמו" ולעקוף נהלים.

ברקע הדברים עמדה פרשת הפעלתו של הנער אורי אלמקייס כסוכן שלא לפי הנהלים, שלטענת ברנע הצביעה על דפוס התנהלות מסוכן במיוחד עבור מי שאמור לעמוד בראש אחד הארגונים החשאיים והרגישים ביותר במדינת ישראל. ברנע אף הזהיר בזמנו כי הסיכון עלול להיות כבד – הן לעובדי המוסד והן לביטחון המדינה.
מנגד, גופמן דחה את הטענות נגדו וטען בפני הוועדה כי המכתב של ברנע מבוסס "בגדול על עובדות שאינן עובדות". לדבריו, הפרסום סביב ההליך גרם לו נזק אישי ובינלאומי, ואף הרחיק ממנו גורמים בעולם המודיעין.

למרות חילופי הדברים החריפים והמאבק הציבורי סביב המינוי, נראה כי במוסד מבקשים כעת לשדר אחדות פנימית עם כניסתו של גופמן לתפקיד. מחר צפוי להתקיים טקס חילופי הפיקוד במטה המוסד, במעמד נשיא המדינה יצחק הרצוג וראש הממשלה בנימין נתניהו.
