לקראת השבת החטופים החללים, בחיל הרבנות הצבאית נערכים על מנת לקלוט ולזהות את החללים החטופים בצורה המהירה והמדויקת ביותר. המכון הלאומי לרפואה משפטית יהיה אמון על הזיהוי והטיפול בחללים האזרחיים.
במקרים בהם המכון יצטרך סיוע בזיהוי, צוותי הרבנות הצבאית ויכולות הזיהוי המתקדמות שלהם יסייעו במה שיצטרכו. לרבנות הצבאית יש אמצעים טכנולוגיים לזהות חללים מצבים מורכבים במיוחד.
כמו כן, כלל חללים חיילים יגיעו למחנה שורה במרכז הארץ, ולחללים החיילים יערכו הלוויות צבאיות. ברבנות הצבאית מדגישים כי הרב הראשי לצה״ל, תא״ל הרב איל קרים יעקוב מקרוב אחר הליך הזיהוי, ויוודא שהוא נעשה בצורה המקצועית ביותר, כפי שעשו צוותי הרבנות הצבאית לאורך המלחמה.
