על רקע הביקורות מצד ארגוני מחאה, נשיא המדינה יצחק הרצוג מעניק גיבוי מלא לראש הממשלה ולמערכת הביטחון בעקבות ההחלטה הדרמטית לתקוף את צמרת חמאס בקטאר. בדבריו, הרצוג הגדיר את הפעולה כ"חשובה ונכונה".
בהודעה שפורסמה מטעם בית הנשיא נכתב כי "החלטת ראש הממשלה ושר הביטחון יחד עם צמרת צה"ל והשב"כ לפגוע בצמרת הטרור של חמאס חשובה ונכונה". הנשיא הזכיר את זהות היעדים והצדיק את הפעולה: "בל נשכח, חליל אל-חיה הוא טרוריסט רצחני עם דם של אלפים על הידיים, מאדריכלי טבח שבעה באוקטובר וכך גם רבים מעמיתיו".
בהתייחסות ישירה לטענות כי התקיפה פוגעת בסיכויים לעסקת חטופים, הרצוג טען כי דווקא בכירי חמאס הם אלו שמונעים עסקה. "צמרת הטרור של חמאס מקשה שוב ושוב על הצעות פשרה לשחרור החטופים. מול הטרור והרוע המוחלט יש להילחם בנחישות ותעוזה כדי להביא בראש ובראשונה לשחרור החטופים וליצור עתיד טוב יותר לנו ולשכנינו".
בסיום דבריו, ביקש הנשיא לחזק את משפחות החטופים, שחלקן הביעו זעם על עיתוי הפעולה. "למדינת ישראל מחויבות מוחלטת לשחרור החטופים", הדגיש, "ובשעה זו חשוב במיוחד לחבק ולחזק את משפחות החטופים ולהמשיך ולפעול בכל דרך להשבתם מגיהינום המרצחים מעזה".
