בישראל מעריכים כי בכירי החמאס נמצאים כרגע במנוסה ממתחם למתחם בתוואי המנהרות, אך הם לא ציפו שצה"ל יגיע לתת קרקע ויתמרן שם. לכן בתת קרקע במחנה הפליטים חאן יונס לא נמצאה היערכות ללחימה. כוחותינו איתרו מפקדה תת קרקעית של מג"ד 'בבני סוהילה' שהתחברה ישירות למפקדה של יחיא סינוואר, ושהייתה מתחת לבית קברות. כך על פי בדיווח של כתבנו הצבאי הלל ביטון רוזן.

החלק התת קרקעי מחולק לשלושה סוגים. תת קרקע טקטי, דרכם מחבלי חמאס נעים ממקום למקום, מנהרות מערכתיות, מנהרות גזע ששייכות לגדוד או לפלוגה ומאפשרות להן להגיע לעשרות הסתעפויות הטקטיות. ותת קרקע אסטרטגי, שם נמצא הפיקוד הבכיר וההערכה היא שגם שם יש חטופים. במנהרות האסטרטגיות יש מתחמים גדולים וגבוהים, ממש כמו אולמות.

עד כה יצאו ממחנה הפליטים בחאן יונס מעל ל-100,000 איש, ונשארו שם בין 30,000-20,000 איש. מתוך האנשים שיצאו מחאן יונס עצרנו כוחותינו כ-340 מחבלים שניסו לעבור. במהלך הפעולה בחאן יונס חיסלו כוחותינו מעל ל-1,000 מחבלים, וההערכה היא כי כוחותינו הצליחו להרוג כשני שליש מהמחבלים שהיו שם לפני תחילת הפעולה.
