מתחילת הלחימה, שב"כ וצה"ל חיסלו כ-20 מחבלים שנמצאים ברצועה וקידמו פיגועים נגד ישראלים. מחצית מהמחבלים שחוסלו משתייכים ל"מטה הגדה", הגוף שאמון על גיוס פעילים מיו"ש וירושלים למימוש פיגועים בישראל, מימון וניהול פעילות חמאס ביו"ש.
כמו כן, הותקפו למעלה מ-10 מטרות בשכונת "מדינת אלעמל", בה שוהים מחבלי חמאס ששוחררו מהכלא הישראלי בעסקת חילופי שבויים – ומאז שחרורם המשיכו לעסוק בקידום פעילות טרור, בדגש על מימון ואכוונה של פיגועי חמאס ביו"ש ובישראל.

בין המחבלים שחוסלו, עבדאללה אבו סיף. במוצאו מחברון, נעצר בשנת 2003 ונשפט למאסר עולם על מעורבות ברצח ישראלים. הוא שוחרר במסגרת "עסקת שליט" והחל לפעול ב"מטה הגדה" של החמאס במטרה לאכוון פעילות חמאס בשטח ובכלל זה לביצוע פיגועים כנגד ישראלים.

מחבל נוסף הינו רמזי עוק. במוצאו מאזור בית לחם, נעצר בשנת 2003 לאחר שגייס מחבל מתאבד שביצע פיגוע התאבדות במאי 2002, לצד מעורבותו בפיגועים נוספים. שוחרר במסגרת "עסקת שליט" ועסק מאז בהכוונת מחבלים מיו"ש לביצוע פיגועים כנגד ישראלים.
מחמוד חלבי, מחבל חמאס שהיה פעיל דומיננטי באירועי ההתפרעויות על הגדר ברצועת עזה בשנת 2021. שימש בשנה האחרונה כמאכוון בין אזורי לביצוע טרור בישראל ואף סייע לפעילות טרור בתוך יו"ש.
מוחמד עוודאללה, מחבל חמאס, ראש לשכתו של ראש מטה הייצור, מראשי תשתית ההכוונה הבין אזורית של חמאס, אביו פעיל חמאס ותיק, מזכיר הועד הפועל של הנהגת חמאס.
