יונתן שפיצר הוא אחד מ-43 שהצטרפו ל"שלב ב'" – מסלול מיוחד במסגרתו מתגייסים חרדים בגיל מאוחר, ובסיומו מתגברים כאנשי מילואים את כוחות מד״א ומסייעים להציל חיים – כך פרסמו בדף הפייסבוק של צה"ל.
עוד כתבו בדף הפייסבוק "מה יש לבנו של יונתן, המשרת בפיקוד המרכז, להגיד על האבא "הצעיר"? ״אני גאה בו על זה שבחר להתגייס בגיל כל כך מאוחר, זה לא מובן מאליו ומראה עד כמה חשוב לו לתרום לעם ישראל. אומנם זה מוזר שאני גבוה ממנו בדרגה, אבל זה רק גורם לי להעריך אותו יותר!".
