מפכ"ל המשטרה, רב ניצב יעקב שבתאי הגיב לטענות לפיהם משטרת ישראל השתמשה בתוכנת הריגול 'פגסוס' לטובת מעקב אחר אזרחים, ביניהם ראשי מחאת הדגלים השחורים, מקורב לפוליטיקאים, ראש עיר ועובדי ממשלה: "הוריתי על בדיקת כל המקרים שעלו בכתבה ושלכאורה התרחשו לפני מספר שנים. מהבדיקה עלה שחלק מהמקרים אינם נכונים" אמר המפכ"ל.
המפכ"ל הכחיש שימוש של המשטרה בתוכנת ריגול נגד המפגינים וראשי הרשויות: "בין השאר, לא התבצע שימוש בכלים מסוג זה מול מפגיני הדגלים השחורים, טלפונים של ראשי רשויות ומעקב אחרי גורמים המתנגדים למצעד הגאווה. פרטים אלה אינם נכונים" הצהיר המפכ"ל, עם זאת הודה כי אכן היה שימוש בכפוף לאישורים הנדרשים: "בכל הנוגע לשימוש באמצעי אכיפה באופן כללי, כאמור, הכל נעשה עם האישורים המשפטיים הנדרשים".

המפכ"ל הבהיר כי "משטרת ישראל אינה מפעילה את יכולותיה הטכנולוגיות המתקדמות אל מול אזרחים ומפגינים תמימים". לדבריו השימוש במערכות הללו נעשה נגד גורמי פשיעה: "אני גאה בשילוב מערכות טכנולוגיות שהפכו לראש חץ במלחמה בפשע, באלימות ובעבריינים. השימוש בטכנולוגיה מתקדמת במאבק בפשיעה הוא אינטרס לאומי ראשון במעלה והוא בא להגן על הציבור שומר החוק בישראל ועל ביטחון הפנים של המדינה. עולם הפשע מתחכם ואנחנו נמשיך לפעול ולעשות הכל בכדי להיות צעד אחד קדימה".
עוד ציין המפכ"ל כי "מדובר באחד התחומים הכי מבוקרים ומפוקחים על ידי כלל הגורמים המשפטיים בתוך הארגון ומחוץ לארגון וביניהם הבכירים ביותר ואני רוצה להבטיח כי משטרת ישראל בראשותי פועלת על פי חוק תוך הקפדה יתרה על צווי בתי המשפט בכל שימוש בכלי כזה או אחר".
מוקדם יותר היום, פירסם העיתונאי תומר גנון ב"כלכליסט" שמשטרת ישראל שתלה מרחוק בטלפונים של ראשי המחאה את תוכנת המעקב NSO, ולמעשה – הצליחה להשתלט להם על המכשירים, להאזין לשיחותיהם ולצפות בכל ההתכתבויות שלהם.
ההוראה לבצע את המעקב באמצעות הרוגלה של NSO ניתנה, כך לפי "כלכליסט", ע"י דרגים גבוהים במשטרה וללא צו בית משפט או פיקוח של שופט, למרות שלא דובר בעבריינים או חשודים. בחטיבת הסייבר המשטרתית "סיגינט" קיבלו את ההוראות מהדרגים הגבוהים, וצוות מבצעים מיוחדים של החטיבה ביצע אותן.

