אריה דרעי נחשב לאחד ממקורביו של ראש הממשלה בנימין נתניהו, עם זאת, בשעה האחרונה התגלע עימות חריג בין השניים בישיבת הממשלה.
על פי הדיווחים השונים במהלך הישיבה שעסקה בסגירת נתב"ג לנכנסים והיוצאים ממדינת ישראל אריה דרעי אמר "צריך להתחשב בעלייה המאורגנת של השבוע הקרוב. תדבר על זה גם שרת העלייה והקליטה".
השרה פנינה תמנו שאטה הגיבה: "כבר חכרנו מטוסים ועולים צריכים לנחות מחר מאוקראינה. יש זקנים וטף אי אפשר להפקיר אותם, אחרי שמכרו את הבתים וכרגע על מזוודות בדרך לארץ".

ראש הממשלה נתניהו: "שיחכו שבוע, תהיה ועדת חריגים לשם כך".
השרה פנינה תמנו שאטה: "אתה שולח לוועדת חריגים, מזה הדבר הזה, אני רוצה שנחליט כאן בממשלה. מעולם לא עצרנו את העלייה מאז קום המדינה גם בעיתות מלחמה ומשבר".
ראש הממשלה נתניהו: "התשובה היא כן, הפעם נעצור. הם יכולים לחכות, זה לא אבסולוטי. אם יש נגיף צריך לעצור גם את העלייה, אנחנו נדאג להם".

השר דרעי: "מזה הדבר הזה, כל הזמן הפרעות בישיבות ממשלה, אי אפשר ככה".
ראש הממשלה נתניהו: "מי הפריע לך".
השר דרעי: "אתה צריך לקבל דעות אחרות".
ראש הממשלה נתניהו: "אני, אני לא יכול לשמוע דעות אחרות?! "
השר דרעי: "תשמע דעות אחרות"
