הנסיך צ'רלס כתב במכתב רשמי מטעם בית המלוכה האנגלי: "שמעתי בצער עמוק ואישי על פטירתו של הרב הלורד זקס. עם פטירתו, הקהילה היהודית, האומה שלנו והעולם כולו איבד מנהיג שאין שני לתבונתו, למדנותו ואנושיותו". עוד הוסיף הנסיך במכתבו כי: "הוא יחסר באופן שמילים לא יוכלו לתאר".
בתוך כך התייחס גם ראש הממשלה בנימין נתניהו לפטירתו של הרב זקס ואמר: "הרב יונתן זקס ז"ל, שהיה הרב הראשי של בריטניה, היה מנהיג רוחני והוגה שהעמיד תלמידים רבים. התובנות שלו על המורשת של עם ישראל ועל האנטישמיות יעמדו לדור שלנו וגם לדורות הבאים. יהי זכרו ברוך".
