התפתחות משמעותית נרשמה הערב (שני) כאשר נשיא המדינה יצחק הרצוג יזם לראשונה מהלך ישיר ורשמי להשגת הסדר בתיקי ראש הממשלה. באמצעות היועצת המשפטית של בית הנשיא, עו"ד מיכל צוק, פנה הרצוג ליועצת המשפטית לממשלה גלי בהרב-מיארה, לפרקליט המדינה עמית איסמן ולסנגורו של נתניהו, עו"ד עמית חדד, והזמין אותם לקיום מגעים דחופים במשכן הנשיא במטרה להגיע להבנות.

"הליך זה נועד לבחון אפשרות לקידום הבנות והסכמות, והוא מהווה שלב מקדים בלבד בטרם יקיים הנשיא דיון בבקשת החנינה עצמה", נכתב בהודעה מטעם הנשיא. "הצדדים התבקשו להגיע בהקדם, בלב חפץ ובכוונה טובה וראויה. לצדדים הובהר כי אין בהיענות להזמנה הסכמה או אישור מטעמם לכל דבר ועניין המצוי במחלוקת ביניהם בבית המשפט".
היועמ"שית גלי בהרב-מיארה מסרה: "במענה לפניות, מכתבו של הנשיא כלל טרם נדון וכל פרסום אחר אינו מבוסס".

המהלך הנוכחי מסמן את האסטרטגיה של הרצוג: ניסיון לייצר מסלול גישור אקטיבי בין הצדדים, לאחר שהבהיר כי סמכות החנינה אינה עומדת על הפרק בשלב זה. הנשיא רואה בשיח המקדים שלב הכרחי בטרם תיבחן בקשת החנינה לגופה, תוך הדגשה כי קיום "שיח מאחה" הוא בעל ערך ציבורי עליון, במיוחד בנושאים הטעונים המצויים בלב המחלוקת בישראל.
במכתב שנשלח לצדדים, הובהר כי ההזמנה לשיח אינה מחייבת את המשתתפים להודות בטענות היריב או לסגת מעמדותיהם המשפטיות בבית המשפט. הנשיא קרא לצדדים להגיע "בלב חפץ ובכוונה טובה", כשהם חופשיים מתנאים מוקדמים, מתוך מטרה למצות כל סיכוי להסדר שיוריד את התיקים מסדר היום הציבורי.

פנייה זו מגיעה על רקע שיטתו של הרצוג להימנע מהכרעה בנושא בקשת החנינה של ראש הממשלה ולנסות להגיע ל"פשרות". על פי המכתב, הנשיא סבור כי פרוצדורה של הסדר מוסכם היא ראויה ויעילה גם בעיני מערכת המשפט, וכי יש למצות את המגעים בין התביעה להגנה בבית הנשיא ככלי לריפוי השסע הציבורי שנוצר סביב ההליך הפלילי של ראש הממשלה.
כזכור, בתחילת השבוע דווח ב"ניו יורק טיימס" כי נשיא המדינה הרצוג לא מתכוון להעניק חנינה לראש הממשלה בשלב זה, ובמקום זה ינסה לקדם הסדר טיעון. לפי הדיווח, הרצוג לא מתכוון להגיב כרגע לבקשת החנינה של ראש הממשלה. בבית הנשיא אישרו בהמשך את הדיווח, ומסרו כי "הסדר בין הצדדים הוא פתרון ראוי ונכון".

בעיתון האמריקני ציטטו שני בכירים ישראלים שאמרו כי הרצוג מאמין שקיימות אפשרויות רבות מעבר לבחירה הבינארית של "חנינה או לא", וכי תפקידו העיקרי של הנשיא הוא לטפח אחדות – ולכן הוא לא מתכוון להגיב בחיוב או בשלילה לבקשת החנינה של נתניהו – ומעדיף לפתור את הסוגייה במשא ומתן.
נתניהו הגיש את בקשת החנינה שלו בסוף נובמבר 2025, והטיפול בבקשת החנינה הועבר לשר עמיחי אליהו מידי שר המשפטים יריב לוין, שהסביר כי העביר את הטיפול כדי לסכל "ניסיונות לעכב את ההליך בחודשים רבים, בטענה שיש לפסול את המלצתו בשל ניגוד עניינים".
