ההתערבות של נשיא המדינה יצחק הרצוג בנושא ההחלטה על סגירת גלי צה"ל הצליחה להכעיס אנשים גם במשרד הביטחון. בעקבות המכתב אותו פרסם מוקדם יותר היום (חמישי) הרצוג בו כתב כי: "המהלך לסגירתו המוחלטת של כלי תקשורת ציבורי ותיק בישראל, מעורר דאגה רבה, ובצדק", גורם ביטחוני בכיר הגיב בזעם.
"אם הנשיא חובב תחנות רדיו שיקים לו אחת בבית הנשיא", נמסר מטעם אותו גורם, "ממשלת ישראל בלבד תקבל את ההחלטות, בהתאם לסמכותה, בנוגע לסגירת גלי צה"ל".

כזכור, נשיא המדינה הדגיש כי סגירת גל"צ מעוררת דאגה במיוחד בשל "התקופה" שבה אנו נמצאים ב"קיטוב פוליטי וחברתי, ושל מאבקים על דמותה של הדמוקרטיה הישראלית".
הוא הוסיף כי "אין ספק ואין חולק על כך שעצם קיומה של תחנת רדיו צבאית-ציבורית בדמוקרטיה ליברלית – הוא חריג וראוי לבחינה, וגם לשינוי ולשיפור. ועם זאת, עלינו לזכור – בסגירת גוף תקשורת – ובמיוחד גוף תקשורת ציבורי – לא נסגר סתם ערוץ, אלא חלון לציבור".

הנשיא ציין כי "גלי צה"ל לא רק משדרת חדשות, היא מלווה את המדינה ואת צה"ל עשרות שנים, ומהווה חלק משמעותי בסיפור המשותף שלנו". הוא קרא לשר הביטחון ישראל כ"ץ, מבלי שנקט בשמו, לחזור בו.
"במיוחד בעת הזאת של חרמות וביטול הדדי, של היעדר הקשבה וכבוד זה לזה – אסור לנו לשכוח שכאשר קולות נמחקים אנחנו מפסידים לא רק תדר, אלא גם דיאלוג. בוודאי שניתן לתקן, בוודאי שצריך לתקן, אבל לא למחוק לחלוטין כלי דמוקרטי קריטי – שמעניק לנו שידור ציבורי. לתקן כן, להרוס לא", כתב הנשיא.
