לרגל ראש השנה תשפ"ו, רכבת ישראל תפעל בלוחות זמנים ייעודיים. בערב החג, יום שני ה-22 בספטמבר, הרכבות יפעלו עד השעה 16:00 במתכונת זהה לימי שישי, עם תוספת תדירות בקו חיפה-תל אביב.
כמו כן, יתווסף שירות בקווים באר שבע-דימונה ואשקלון-באר שבע. תנועת הרכבות תחודש במוצאי החג, יום רביעי ה-25 בספטמבר, החל מהשעה 21:00 במתכונת הזהה לזו של מוצאי שבת.

על פי הודעת רכבת ישראל, במוצאי החג תהיה תוספת שירות בצפון ובדרום, כמו גם רכבות לילה בקו נהריה-נתב"ג. לוחות הזמנים המלאים מעודכנים באתר הרכבת ובאפליקציות הנסיעה השונות.
