לאחר ההשתלחות של ראש השב"כ רונן בר נגד רה"מ נתניהו, במכתב מפורט שצורף להודעה מטעם היועמש"ית שבו נטען כי חוסר האמון של נתניהו בבר לא נבע משיקולים מקצועיים אלא בשל סירובו למסור חוות דעת בעד רה"מ נתניהו בסוגיית עדותו בביהמ"ש, בלשכת רה"מ מגיבים לטענות.
"חוסר-האמון בראש השב"כ שנוצר לראש הממשלה ולכל חברי הממשלה – בלי יוצא מן הכלל – לא נבע משאלת נאמנות אישית, אלא נבע מחוסר-האמון בתפקודו לאחר חלקו המכריע במחדל השבעה באוקטובר שבו בחר לא לעדכן את הדרג המדיני, ובשורת אירועים שערערו את האמון המקצועי בו לאחר מכן" נמסר מטעם הלשכה.

בלשכה האשימו את התנהלותו של בר לאחר פיטוריו. "היחיד שמונע ממניעים אישיים הוא ראש השב״כ שנאחז בקרנות המזבח ומתעקש להישאר בתפקידו לאחר שאיבד את אמון הממשלה כולה". עוד נמסר כי "הודעת ראש השב״כ נגועה בניגוד עניינים חריף, ובאופן לא מפתיע היא באה במקביל למכתבה של היועמ״שית – שגם היא נגועה בניגוד עניינים חריף".
לדברי הלשכה, "הודעה זו רצופה בשקרים, כגון הטענה שראש הממשלה ביקש מראש השב״כ להשתמש בסמכויות הארגון בצורה לא ראויה נגד אזרחי ישראל – דבר שמעולם לא היה".

באשר לטענות של בר על בקשת נתניהו לחוות דעת בסוגיית משפט תיקי האלפים נמסר: "ראש הממשלה שוחח עם ראש השב״כ על הדרכים לאפשר את עדותו בבית המשפט לאור איומי הטילים על ישראל ועל ראש הממשלה בפרט. הדיון שהתקיים בנושא היה על מיקום העדות ולא על קיומה. ואכן, גורמי המקצוע בשב״כ קבעו שיש לקיים את הדיונים במרחב המוגן בבית המשפט המחוזי בתל-אביב ולא במקום אחר. וכך אכן מתקיימים הדיונים".
